Tên luận án:
NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM DI TRUYỀN VÀ TÍNH KHÁNG THUỐC CỦA VIBRIO CHOLERAE PHÂN LẬP TẠI TỈNH TRÀ VINH
Ngành:
VI SINH VẬT HỌC
Tóm tắt nội dung tài liệu:
Luận án "Nghiên cứu đặc điểm di truyền và tính kháng thuốc của Vibrio cholerae phân lập tại tỉnh Trà Vinh" tập trung vào vấn đề dịch tả, một bệnh truyền nhiễm cấp tính do vi khuẩn Gram âm Vibrio cholerae gây ra, có lịch sử gây ra 7 đại dịch trên toàn cầu. Đại dịch thứ 7, do V. cholerae type sinh học El Tor, vẫn còn gây bùng phát dịch ở nhiều nước. Tại Đồng bằng sông Cửu Long, trong đó có tỉnh Trà Vinh với bờ biển dài 65 km và hệ thống sông chính 578 km, tiềm ẩn nguy cơ cao về sự lưu hành vi khuẩn tả. Vấn đề kháng kháng sinh của V. cholerae đang ngày càng phức tạp do sự lây truyền các gene kháng kháng sinh qua các yếu tố di truyền như plasmid, integrons và transposons.
Mục tiêu chính của nghiên cứu là xác định tỉ lệ nhiễm và type huyết thanh học của các chủng V. cholerae phân lập được, làm rõ đặc tính kháng sinh và các kiểu đột biến gene gây kháng thuốc, đánh giá quan hệ di truyền giữa các chủng phân lập với các chủng đã công bố, và khảo sát tính đáp ứng miễn dịch của V. cholerae với vaccine hiện hành.
Nghiên cứu này là công trình đầu tiên tại Đồng bằng sông Cửu Long phân lập 6 chủng V. cholerae từ các mẫu thức ăn từ hải sản, nước sông và nước ao nuôi tôm. Các điểm mới bao gồm việc xác định type huyết thanh Ogawa và Inaba, sự tương đồng về trình tự nucleotide của các chủng phân lập với các chủng ở Đông Nam Á, và phát hiện gene kháng tetracycline (tetA).
Kết quả cho thấy đã phân lập được 25 chủng Vibrio spp., trong đó 6 chủng thuộc V. cholerae (24%). Các chủng V. cholerae này dương tính với kháng huyết thanh Ogawa và Inaba, nhưng không phát hiện O139. Về tính kháng thuốc, V. cholerae nhạy cảm cao với norfloxacin (100%), ampicillin (83%) và amoxicillin-clavulanic acid (83%). Tuy nhiên, chúng cũng đề kháng với vancomycin (67%), streptomycin (50%), tetracycline (33%) và trimethoprim-sulfamethoxazole (33%). Hai trong số sáu chủng V. cholerae kiểm tra chứa gene kháng tetA. Thử nghiệm trên thỏ cho thấy có đáp ứng miễn dịch đối với vaccine có thành phần kháng nguyên nhóm huyết thanh O1. Những kết quả này cung cấp cơ sở khoa học quan trọng cho việc xây dựng chiến lược sử dụng kháng sinh và phát triển vaccine phòng bệnh tả hiệu quả trong khu vực.
Mục lục chi tiết:
- Chương 1: GIỚI THIỆU (4 trang)
- 1.1 Tính cấp thiết của đề tài
- 1.2 Mục tiêu:
- 1.3 Ý nghĩa của luận án:
- 1.4 Những điểm mới của luận án
- Bố cục của luận án
- Chương 2: TỔNG QUAN TÀI LIỆU (42 trang)
- 2.1 Lịch sử bệnh do vi khuẩn tả
- 2.2 Phân loại – Đặc điểm vi khuẩn Vibrio cholerae
- 2.2.1 Phân loại vi khuẩn V. cholerae
- 2.2.2 Đặc điểm hình dạng của Vibrio cholerae
- 2.2.3 Đặc tính di truyền về độc lực của Vibrio cholerae
- 2.2.4 Các yếu tố về độc lực
- Chương 3: NỘI DUNG, PHƯƠNG TIỆN VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU (18 trang)
- 3.1 Nội dung nghiên cứu
- 3.2 Phương tiện và phương pháp nghiên cứu
- 3.2.1 Phương tiện nghiên cứu
- 3.2.1.1 Hoá chất, môi trường nuôi cấy vi khuẩn
- 3.2.1.2 Hoá chất, sinh phẩm dùng cho phản ứng PCR
- Xác định gene kháng kháng sinh
- 3.2.1.3 Vật liệu nghiên cứu
- 3.2.1.4 Thiết bị - Dụng cụ
- 3.2.2 Phương pháp nghiên cứu
- 3.2.2.1 Phương pháp phân lập, định danh vi khuẩn
- 3.2.2.2 Phân tích trình tự gene 16S RNAvà thiết lập cây di truyền.
- 3.2.2.3 Xác định sự kháng kháng sinh của vi khuẩn V. cholerae
- 3.2.2.4 Phân tích trình tự gene kháng kháng sinh và thiết lập cây di truyền.
- 3.2.2.5 Thử nghiệm chủng V. cholerae phân lập và đáp ứng miễn dịch trên thỏ đối với vaccine tả.
- Chương 4: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN (43 trang)
- 4.1 Kết quả phân lập và định danh Vibrio spp.
- 4.1.1 Kết quả phân lập Vibrio spp.
- 4.1.2 Kết quả định danh Vibrio spp. bằng phản ứng sinh hóa
- 4.1.3 Kết quả định danh Vibrio spp. bằng kỹ thuật PCR
- 4.1.5 Tỉ lệ hát hiện Vibrio spp. trên các loại mẫu phân lập
- 4.2 Kết quả định type huyết thanh
- 4.3 Kết quả tính tương đồng giữa các loài thuộc Vibrio trên Genbank bằng công cụ BLAST
- 4.4 Sự kháng kháng sinh của V. cholerae
- 4.4.1 Kết quả khảo sát sự kháng KS của V. cholerae bằng phương pháp Kirby Bauer (CLSI, 2010)
- 4.4. Sự hiện diện một số gene kháng kháng sinh ở các vi khuẩn phân lập bằng kỹ thuật PCR
- 4.4.5 Kết quả so sánh trình tự nucleotide của chủng V. cholerae T1, T3 với chủng V. cholerae hoang dại N16961 tìm các dạng đột biến
- 4.4.6 Quan hệ di truyền của các chủng V. cholerae dựa vào gene kháng kháng sinh tetA
- 4.5 Thử nghiệm độc lực chủng V. cholerae và đánh giá đáp ứng miễn dịch trên thỏ.
- 4.5.1 Kết quả đánh giá chủng V. cholerae đối với thỏ không uống vaccine phòng bệnh tả.
- 4.5.1.1 Lượng dịch lỏng FA (Fluid accumulation):
- 4.5.1.2 Số lượng V. cholerae bám dính trên niêm mạc ruột non đối với thỏ không uống vaccine phòng bệnh tả.
- 4.5.2 Kết quả đánh giá tính đáp ứng miễn dịch trên thỏ đã uống vaccine phòng bệnh tả
- 4.5.2.1 Lượng dịch lỏng FA (Fluid accumulation):
- 4.5.2.2 Số lượng V. cholerae bám dính trên niêm mạc ruột non đối với thỏ đã uống vaccine phòng bệnh tả
- Chương 5: KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ (1 trang)
- DANH MỤC CÁC CÔNG TRÌNH ĐÃ CÔNG BỐ CÓ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN