Tên luận án:
NGHIÊN CỨU SỰ HIỆN DIỆN VÀ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA VI KHUẨN STAPHYLOCOCCUS SPP. TRÊN CHÓ TẠI THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH
Ngành:
Bệnh lý học và chữa bệnh vật nuôi
Tóm tắt nội dung tài liệu:
Luận án tiến sĩ này tập trung nghiên cứu toàn diện về sự hiện diện, tính đề kháng kháng sinh, các yếu tố độc lực và đặc điểm di truyền của vi khuẩn Staphylococcus spp. trên chó tại Thành phố Hồ Chí Minh. Staphylococcus spp. là tác nhân gây bệnh phổ biến trên chó, đặc biệt khi hệ miễn dịch suy giảm, và tình trạng đa đề kháng kháng sinh của chúng ngày càng gia tăng, gây khó khăn trong điều trị. Nghiên cứu này nhằm xác định tỷ lệ hiện diện, định danh loài, các yếu tố nguy cơ liên quan đến nhiễm khuẩn, đồng thời đánh giá kiểu hình đề kháng kháng sinh và sự hiện diện của các gene mã hóa đề kháng kháng sinh, cũng như các gene độc lực.
Kết quả cho thấy tỷ lệ hiện diện Staphylococcus spp. trên chó tại TP. HCM là 71,22%, cao hơn ở chó bệnh (78,95%) so với chó khỏe (56,94%) và trên mẫu da (80,09%) so với dịch mũi (60,33%). Sự hiện diện của vi khuẩn phụ thuộc vào tình trạng sức khỏe, lứa tuổi và phương thức nuôi. Loài S. pseudintermedius chiếm tỷ lệ cao nhất. Vi khuẩn Staphylococcus spp. phân lập từ chó cho thấy mức độ đề kháng cao với các kháng sinh nhóm beta-lactame (amoxicillin, penicillin, ampicillin) và một số kháng sinh khác, với tỷ lệ đa đề kháng là 60,52%. Tuy nhiên, chúng vẫn nhạy cảm với linezolid, vancomycin, amikacin, cephalexin, amoxicillin/clavulanic acid, cefoxitin và levofloxacin.
Về mặt di truyền, gene aacA-aphD và tetK là những gene đề kháng kháng sinh chiếm ưu thế, tạo ra 51 kiểu hình gene đề kháng. Các gene độc lực siet và lukF cũng được phát hiện phổ biến. Giải trình tự toàn bộ hệ gene của ba chủng Staphylococcus đa kháng đại diện (S. aureus SB2.2, S. pseudintermedius RB10.2 và SB24) đã xác định 11 gene mã hóa đề kháng kháng sinh và 10 gene độc lực cùng hiện diện, đồng thời chỉ ra mối liên hệ di truyền với các chủng Staphylococcus trên cả chó và người. Nghiên cứu cung cấp cơ sở khoa học quan trọng cho việc lựa chọn kháng sinh hiệu quả, hỗ trợ điều trị và là nền tảng cho các nghiên cứu sâu hơn về dịch tễ học phân tử của Staphylococcus spp. ở chó tại Việt Nam.
Mục lục chi tiết:
- Chương 1: GIỚI THIỆU
- 1.1 Tính cấp thiết của đề tài
- 1.2 Mục tiêu
- 1.3 Ý nghĩa thực tiễn
- 1.4 Những điểm mới của luận án
- Chương 2: TỔNG QUAN TÀI LIỆU
- 2.1.1 Tình hình nghiên cứu về Staphylococcus spp. trên chó ở trong nước
- Chương 3: PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
- 3.1 Nội dung nghiên cứu
- 3.2 Thời gian và địa điểm nghiên cứu
- 3.3 Phương tiện nghiên cứu
- 3.4 Phương pháp nghiên cứu
- 3.4.1 Khảo sát sự hiện diện, định danh loài và một số yếu tố nguy cơ của Staphylococcus spp. trên chó
- 3.4.1.1 Đối tượng nghiên cứu
- 3.4.1.2 Loại mẫu và dung lượng mẫu
- 3.4.1.3 Phương pháp chẩn đoán lâm sàng
- 3.4.1.4 Phương pháp thu thập mẫu
- 3.4.1.5 Phương pháp nuôi cấy và phân lập Staphylococcus
- 3.4.1.6 Phương pháp PCR định danh vi khuẩn Staphylococcus
- 3.4.1.7 Xác định một số yếu tố nguy cơ có liên quan đến hiện diện của Staphylococcus spp. trên chó
- 3.4.1.8 Các chỉ tiêu theo dõi
- 3.4.2 Xác định sự đề kháng và hiện diện của một số gene mã hóa đề kháng kháng sinh của Staphylococcus spp. trên chó
- 3.4.2.1 Đối tượng nghiên cứu
- 3.4.2.2 Phương pháp xác định đề kháng của Staphylococcus spp. với kháng sinh
- 3.4.2.3 Phương pháp PCR xác định sự hiện diện một số gene mã hóa sự đề kháng kháng sinh của Staphylococcus spp.
- 3.4.2.4 Chỉ tiêu theo dõi và công thức tính
- 3.4.3 Xác định sự hiện diện của một số gene mã hóa độc lực của Staphylococcus spp.
- 3.4.3.1 Đối tượng nghiên cứu
- 3.4.3.2 Phương pháp PCR xác định sự hiện diện một số gene mã hóa yếu tố độc lực của Staphylococcus spp.
- 3.4.3.3 Chỉ tiêu theo dõi và công thức tính
- 3.4.4 Giải trình tự, xây dựng toàn bộ hệ gene và xác định đặc điểm di truyền của một số chủng Staphylococcus spp. đa kháng
- 3.4.4.1 Đối tượng nghiên cứu
- 3.4.4.2 Phương pháp giải trình tự toàn bộ hệ gene
- 3.4.4.3 Chỉ tiêu theo dõi
- 3.4.5 Phương pháp xử lý số liệu
- Chương 4: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
- 4.1 Sự hiện diện và các yếu tố nguy cơ của Staphylococcus spp.
- 4.1.1 Sự hiện diện Staphylococcus spp. trên chó
- 4.1.2 Phân bố của một số chủng Staphylococcus trên chó
- 4.1.3 Sự phân bố của các chủng Staphylococcus sinh coagulase
- 4.1.4 Một số yếu tố nguy cơ sự hiện diện của Staphylococcus
- 4.1.5 Tần suất biểu hiện bệnh trên chó phát hiện Staphylococcus
- 4.1.5.1 Tần suất biểu hiện bệnh trên chó bệnh đường hô hấp phát hiện Staphylococcus
- 4.1.5.2 Tần suất biểu hiện bệnh trên chó viêm da phát hiện Staphylococcus spp.
- 4.2 Kết quả khảo sát tính đề kháng đối với kháng sinh và hiện diện của một số gene mã hóa sự đề kháng kháng sinh
- 4.2.1 Tính đề kháng kháng sinh của Staphylococcus spp.
- 4.2.2 Kiểu hình kháng kháng sinh của Staphylococcus
- 4.2.3 Kết quả xác định sự hiện diện các gene đề kháng kháng sinh của Staphylococcus spp.
- 4.2.3.1 Kết quả xác định các gene đề kháng kháng sinh của Staphylococcus spp.
- 4.2.3.2 Kết quả khảo sát kiểu hình của các gene kháng kháng sinh của Staphylococcus
- 4.2.4 Mối liên hệ giữa kiểu hình và kiểu gene kháng kháng sinh của Staphylococcus spp. phân lập được
- 4.3 Kết quả khảo sát hiện diện gene độc lực của Staphylococcus
- 4.3.1 Kết quả hiện diện gene độc lực của Staphylococcus
- 4.3.2 Kết quả kiểu hình của gene độc lực của Staphylococcus
- 4.4 Giải trình tự một số chủng Staphylococcus spp. đa kháng
- 4.4.1 Kết quả định danh và đặc điểm di truyền của 3 chủng Staphylococcus đa kháng dựa trên dữ liệu trình tự toàn bộ hệ gene
- 4.4.2 Kết quả phân tích sự hiện diện gene mã hóa đề kháng kháng sinh dựa trên dữ liệu trình tự toàn bộ hệ gene
- 4.4.3 Kết quả sự hiện diện các gene mã hoá yếu tố độc lực
- 4.4.4 Xác định đặc điểm và quan hệ di truyền của Staphylococcus
- Chương 5: KẾT LUẬN VÀ ĐỀ XUẤT