NGHIÊN CỨU PHÁT SINH LOÀI, PHÂN LOẠI VÀ ĐẶC ĐIỂM CÁC CHỦNG VI KHUẨN ACETIC KÍCH THÍCH SINH TRƯỞNG THỰC VẬT PHÂN LẬP TẠI CÁC TỈNH PHÍA NAM VIỆT NAM
Vi sinh vật học (thuộc Công nghệ sinh học)
Luận án này tập trung vào nghiên cứu phát sinh loài, phân loại và đặc điểm của các chủng vi khuẩn acetic kích thích sinh trưởng thực vật (PGP-AAB) được phân lập tại các tỉnh phía Nam Việt Nam. Xuất phát từ thực trạng Việt Nam có đa dạng sinh học cao nhưng thiếu nghiên cứu về nguồn gen PGP-AAB, đề tài nhằm khảo sát sự đa dạng và xây dựng quỹ gen phục vụ phát triển nông nghiệp bền vững. Nội dung nghiên cứu chính bao gồm việc phân lập, phân loại và định danh các chủng AAB có tiềm năng kích thích sinh trưởng thực vật (KTSTTV) từ các mẫu đất, rễ, thân, lá và gié hoa thu thập tại các khu vực canh tác lúa, mía. Luận án cũng tập trung vào việc nghiên cứu đặc điểm KTSTTV của loài Nguyenibacter vanlangensis – đơn vị phân loại được phát hiện lần đầu ở Việt Nam, phân loại và mô tả đặc điểm của chủng Neoasaia sp. VTH-Ai107 thuộc chi ít gặp, cùng với chủng chuẩn N. chiangmaiensis TBRC 1T. Đặc biệt, luận án còn xác định đặc điểm và đề xuất loài mới Acetobacter sacchari sp. nov. từ hai chủng VTH-Ai14 và VTH-Ai15 phân lập từ cây mía tại Bình Phước.
Kết quả nghiên cứu đã phân loại và định danh được 141 chủng PGP-AAB, trong đó 120 chủng có khả năng cố định đạm và 21 chủng chuyển hóa lân. Các chủng này thuộc 6 chi trong họ Acetobacteraceae, với Asaia là chi phổ biến nhất (59 chủng), theo sau là Nguyenibacter (40 chủng) và Gluconacetobacter (34 chủng). Luận án đã phát hiện thêm 3 loài thuộc nhóm PGP-AAB: Ng. vanlangensis và N. chiangmaiensis (trước đây chưa được công nhận là PGP-AAB) và loài mới A. sacchari. Các đặc tính KTSTTV của Ng. vanlangensis được xác định bao gồm khả năng cố định đạm, chuyển hóa lân và kẽm về dạng hòa tan, tổng hợp hormone auxin phụ thuộc L-tryptophan và kích thích tăng cường biểu hiện gen kháng bệnh pr-1 ở thực vật. N. chiangmaiensis cũng được chứng minh là PGP-AAB với khả năng sinh trưởng trong môi trường vô đạm và tạo auxin. Loài A. sacchari mới được công bố cũng thể hiện khả năng chuyển hóa kẽm, tổng hợp auxin và cố định đạm. Luận án cũng ghi nhận một số đặc điểm mới của A. nitrogenifigens, A. aceti và N. chiangmaiensis, góp phần làm phong phú thêm kiến thức về đa dạng và tiềm năng ứng dụng của nhóm vi khuẩn này trong nông nghiệp.
1. Tính cấp thiết của luận án
2. Mục tiêu nghiên cứu của luận án
3. Các nội dung nghiên cứu chính của luận án
1.1. Phân loại học AAB
1.2. PGP-AAB và tiềm năng ứng dụng
1.3. Các phương pháp nghiên cứu trong phân loại học AAB
1.3.1. Phân loại dựa vào các phân tích đặc điểm kiểu hình
1.3.2. Phân loại dựa vào các phân tích đặc điểm hóa học
1.3.3. Phân loại dựa vào các phân tích đặc điểm kiểu gen
1.4. Nghiên cứu về phân loại và hệ thống học AAB ở Việt Nam
2.1. Vật liệu
2.1.1. Nguồn mẫu, chủng vi sinh vật và thực vật khảo nghiệm
2.1.2. Các trình tự DNA mồi
2.2. Phương pháp và bố trí thí nghiệm
2.2.1. Phương pháp nghiên cứu
2.2.2. Bố trí thí nghiệm
3.1. Thu thập và phân loại AAB có khả năng thuộc nhóm KTSTTV
3.2. Xác định đặc tính KTSTTV của Nguyenibacter vanlangensis
3.3. Định danh Neoasaia sp. VTH-Ai107 và đặc tính KTSTTV của N. chiangmaiensis
3.3.1. Phân loại theo đặc điểm vật chất di truyền
3.3.2. Một số ghi nhận về đặc điểm AC28T và VTH-Ai107
3.3.3. Một số đặc tính KTSTTV của N. chiangmaiensis TBRC 1T và VTH-Ai107
3.4. Đặc điểm phân loại Acetobacter sp. VTH-Ai14 và VTH-Ai15; loài mới Acetobacter sacchari sp. nov., chủng chuẩn VTH-Ai14T
3.4.1. Đặc điểm kiểu gen
3.3.2. Đặc điểm kiểu hình
3.3.5. Loài mới Acetobacter sacchari sp. nov., Vu et al. 2019
Kết luận
Kiến nghị
NHỮNG ĐÓNG GÓP MỚI CỦA LUẬN ÁN
DANH MỤC CÁC CÔNG TRÌNH ĐÃ CÔNG BỐ